有氧呼吸是指细胞或微生物在氧的参与下，通过多种酶的催化作用，把有机物彻底氧化分解，产生二氧化碳和水，释放能量，合成大量ATP的过程。以下是有氧呼吸的总反应式。
有氧呼吸总反应式
C6H12O6+6H2O+6O2→6CO2+12H2O+大量能量（最多38个ATP，一般是29-30个ATP）
在有氧呼吸过程中，葡萄糖彻底氧化分解，1mol的葡萄糖在彻底氧分解以后，共释放出2870kJ的能量，其中有1161kJ的能量储存在ATP中，1709kJ以热能形式散失。利用率为40.45%
有氧呼吸和无氧呼吸的区别
1.呼吸场所的区别： 有氧呼吸主要在线粒体内，无氧呼吸主要在细胞质基质内。
2.是否需要氧气的区别： 有氧呼吸需要氧分子参加，无氧呼吸不需要氧分子参加。
3.分解产物的区别： 有氧呼吸的分解产物是二氧化碳和水，无氧呼吸的分解产物是CO2、C2H5OH、C3H3O3。
4.释放能量的区别： 有氧呼吸释放的能量较多，无氧呼吸释放的能量较少。
呼吸作用的实质
呼吸作用的实质是生物体在有氧或无氧条件下分解有机物，将有机物分解成小分子物质，同时释放出储存在有机物化学键中的能量，用于生物体的各项生命活动。
呼吸作用，是生物体细胞把有机物氧化分解并产生能量的化学过程，又称为细胞呼吸。无论是否自养，细胞内完成生命活动所需的能量，都是来自呼吸作用。真核细胞中，线粒体是与呼吸作用最有关联的胞器，呼吸作用的几个关键性步骤都在其中进行。