南开大学按专业类成立专家组，组织专家对考生的申请材料进行审核，初审结果分为优秀、合格、不合格三档。初审结果为优秀、合格的考生可参加南开大学2020年自主招生考试，测试形式为笔试和综合面试。
各专业考试形式如下：
报考数学类、医药类、生物科学类、信息技术类、人文社科类初审结果为合格的考生笔试通过后方可参加综合面试。
笔试分为理科基础和文科基础，综合面试重点考察考生的逻辑思维能力、语言表达能力、创新意识、思维敏锐性、沟通能力。英语面试为全英文面试，重点考察考生的英语口语表达能力、思维敏锐性、沟通能力。