南方科技大学2013自主招生网上报名大约1月15日至2月5日完成。南科大2013年的自主招生，在原有8个省的基础上新增了6个，分别是浙江、江苏、河北、陕西、江西、辽宁。今年还新增了面试环节。
招办刘静说，学生报考基本步骤跟2012年的差不多——
先在南科大招办网站上报名。提交有学校盖章的高一、高二、高三每学期期末考试成绩单。在招生网上填写自己的姓名等基本信息。提供一份手写自述，自述不限定题目，学生可以在自述上说说自己的学习计划、对理想大学的思考、自己的特长等。如果考生有证明自己能力特长的材料，也请一并递交。这个过程，大概在1月15日至2月5日左右完成。
专家组对考生的材料审核完毕后，一部分获考试资格的考生在杭州参加南科大的自主招生考试。
高考结束后，上线的考生在杭州参加南科大的面试，面试通过后，考生填写志愿，通过提前批录取到南科大。
录取标准：高考成绩、自主招生、平时成绩6∶3∶1
南科大在浙江的招考，仍按2012年的模式，高考成绩、南科大的自主招生考试成绩和学生平时成绩要换算成百分制，按照6∶3∶1分配。也就是说，高考分数占百分制中的60分，自主招生分数(满分100分)占百分制中的30分，这一招生模式已得到教育部认可。按折算比例看，自主招生考试中获得1分，相当于高考成绩好几分。想进入南科大，考好自主招生考试非常重要。
南科大招生办公室主任赵红军说，2012年，南方科技大学共录取新生188人。8个省共有5932名应届高中毕业生报名参加学校的能力测试。经过专家组审核，1357名学生获得能力测试资格，实际参加能力测试的考生共1307人。如果仅用高考成绩来衡量，2012年南科大录取的新生高考平均成绩超出一本分数线69.475分，已经达到了985高校的中上游水平。
赵红军说，南科大的自主招生，不仅只看高考成绩，还要看学校的自主测试。2012年，一些高考成绩好的考生，因为自主招考没考好，最终被退档。
另外，南科大看重学生的创新力、想象力。朱清时说，南科大要培养创新拔尖人才，创新人才有很多特质，如有批判精神，不盲从；有很强的想象力、洞察力、注意力和记忆力；有非常系统的基础知识等。
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